Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ERVFC1P60507 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms