Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR5P51681 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR5P51681 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR5P51681 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR5P51681 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR5P51681 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR5P51681 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR5P51681 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR5P51681 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR5P51681 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR5P51681 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCR5P51681 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCR5P51681 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCR5P51681 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCR5P51681 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCR5P51681 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCR5P51681 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CCR5P51681 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCR5P51681 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCR5P51681 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCR5P51681 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR5P51681 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR5P51681 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR5P51681 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR5P51681 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR5P51681 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR5P51681 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR5P51681 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCR5P51681 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms