Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GCLCP48506 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GCLCP48506 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLCP48506 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms