Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ME1P48163 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ME1P48163 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ME1P48163 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
ME1P48163 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ME1P48163 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms