Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGAEP38570 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ITGAEP38570 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms