Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FDFT1P37268 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FDFT1P37268 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms