Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRIM23P36406 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms