Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFNP31947 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFNP31947 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFNP31947 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFNP31947 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFNP31947 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SFNP31947 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SFNP31947 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SFNP31947 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFNP31947 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFNP31947 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFNP31947 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFNP31947 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFNP31947 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SFNP31947 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms