Protein–RNA interactions for Protein: P31150

GDI1, Rab GDP dissociation inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDI1P31150 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDI1P31150 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDI1P31150 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDI1P31150 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDI1P31150 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDI1P31150 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDI1P31150 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDI1P31150 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDI1P31150 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDI1P31150 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDI1P31150 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDI1P31150 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GDI1P31150 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GDI1P31150 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GDI1P31150 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms