Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LMO1P25800 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LMO1P25800 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LMO1P25800 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LMO1P25800 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LMO1P25800 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LMO1P25800 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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