Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
APCP25054 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC13□□□□□ -0.33
APCP25054 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
APCP25054 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
APCP25054 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
APCP25054 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
APCP25054 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
APCP25054 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
APCP25054 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
APCP25054 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
APCP25054 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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