Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MMP11P24347 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MMP11P24347 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MMP11P24347 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MMP11P24347 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MMP11P24347 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MMP11P24347 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MMP11P24347 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MMP11P24347 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MMP11P24347 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MMP11P24347 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MMP11P24347 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MMP11P24347 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
MMP11P24347 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MMP11P24347 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MMP11P24347 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MMP11P24347 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MMP11P24347 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MMP11P24347 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MMP11P24347 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MMP11P24347 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MMP11P24347 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MMP11P24347 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MMP11P24347 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
MMP11P24347 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms