Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTPREP23469 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPREP23469 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPREP23469 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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