Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TNNI3P19429 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TNNI3P19429 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms