Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

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Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BCKDHAP12694 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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