Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SMIM10L2BP0DMW5 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms