Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
TRAPPC2BP0DI82 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms