Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CENPBP07199 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CENPBP07199 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CENPBP07199 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPBP07199 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPBP07199 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPBP07199 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPBP07199 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPBP07199 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPBP07199 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms