Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CREB3O43889 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CREB3O43889 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CREB3O43889 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms