Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP9BO43861 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms