Protein–RNA interactions for Protein: O43345

ZNF208, Zinc finger protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 1,280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF208O43345 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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ZNF208O43345 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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ZNF208O43345 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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ZNF208O43345 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF208O43345 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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ZNF208O43345 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF208O43345 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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ZNF208O43345 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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