Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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LRRTM2O43300 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LRRTM2O43300 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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