Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UBDO15205 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UBDO15205 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UBDO15205 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms