Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
E2F3O00716 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F3O00716 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F3O00716 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F3O00716 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F3O00716 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F3O00716 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F3O00716 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F3O00716 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F3O00716 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F3O00716 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F3O00716 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F3O00716 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F3O00716 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F3O00716 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F3O00716 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F3O00716 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
E2F3O00716 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
E2F3O00716 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
E2F3O00716 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms