Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
APOC4-APOC2K7ER74 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms