Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms