Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF25A6NGN4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms