Protein–RNA interactions for Protein: A4FU01

MTMR11, Myotubularin-related protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR11A4FU01 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MTMR11A4FU01 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MTMR11A4FU01 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms