Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HMX2A2RU54 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HMX2A2RU54 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HMX2A2RU54 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HMX2A2RU54 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HMX2A2RU54 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HMX2A2RU54 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HMX2A2RU54 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMX2A2RU54 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMX2A2RU54 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HMX2A2RU54 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMX2A2RU54 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMX2A2RU54 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMX2A2RU54 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMX2A2RU54 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMX2A2RU54 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HMX2A2RU54 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms