Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
E2F8A0AVK6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms