Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM213A-205ENST00000606162 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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ARL2-SNX15V9GYD0 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
ARL2-SNX15V9GYD0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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