Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PIAS3Q9Y6X2 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms