Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TNPO3Q9Y5L0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms