Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SH3BP1Q9Y3L3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SH3BP1Q9Y3L3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SH3BP1Q9Y3L3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SH3BP1Q9Y3L3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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SH3BP1Q9Y3L3 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SH3BP1Q9Y3L3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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