Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SHANK2Q9UPX8 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SHANK2Q9UPX8 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms