Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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USP18Q9UMW8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
USP18Q9UMW8 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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