Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SCHIP1Q9P0W5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms