Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CNIH4Q9P003 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CNIH4Q9P003 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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CNIH4Q9P003 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CNIH4Q9P003 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CNIH4Q9P003 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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