Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms