Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MIS18AQ9NYP9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms