Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COMMD8Q9NX08 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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