Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATG3Q9NT62 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms