Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RAB18Q9NP72 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB18Q9NP72 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms