Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LY9Q9HBG7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
LY9Q9HBG7 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LY9Q9HBG7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LY9Q9HBG7 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LY9Q9HBG7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LY9Q9HBG7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LY9Q9HBG7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LY9Q9HBG7 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LY9Q9HBG7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LY9Q9HBG7 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LY9Q9HBG7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LY9Q9HBG7 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms