Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NRDE2Q9H7Z3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms