Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CIPCQ9C0C6 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms