Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FOXQ1Q9C009 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FOXQ1Q9C009 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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FOXQ1Q9C009 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXQ1Q9C009 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXQ1Q9C009 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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