Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms