Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNPPD1Q9BV87 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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