Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TINF2Q9BSI4 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
TINF2Q9BSI4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms